Οι εταίροι είναι φορείς που δεν χρειάζεται να έχουν τοπική παρουσία. Συνεργάζονται με το Γεωπάρκο σε δραστηριότητες σχεδιασμού και δραστηριοποιούνται σε θέματα που αφορούν το σύνολο ή μεγάλο μέρος της περιοχής (π.χ. εκπαίδευση, πολιτιστικές εκδηλώσεις κλπ.). Εταίροι είναι De Facto όλοι οι φορείς που συμμετέχουν στην επιτροπή διαχείρισης. Η συνεργασία αντικατοπτρίζεται σε μια συμφωνία συνεργασίας. (δεν απαιτούνται προδιαγραφές οπως στο Τοπικό Σήμα Ποιότητας)

1. Μουσείο Ελεύθερνας 
2. Σπήλαιο Ζωνιανών  
3. Σπήλαιο Μελιδονίου
4. Κέντρο Περιβαλλοντικής Εκπαίδευσης Ανωγείων 
5. Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Κρήτης